175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0168 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0168  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0035  tRNA-Gln  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.446482  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0016  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0053  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000068806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0002  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0022  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.310652  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0043  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.394082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0011  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6012  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0017  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000220842  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0046  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0004  tRNA-Gln  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.39756 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0003  tRNA-Gln  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.402253 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0005  tRNA-Gln  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.400107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0012  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1538  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1545  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.87406e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0008  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0008  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0019  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349932  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t06  tRNA-Gln  96.88 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0025  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2518  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0017354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2529  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2621  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0485041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2307  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000654744  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0236  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0012758  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1924  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00590264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0028  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0079  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0010  tRNA-Gln  88.14 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277758  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0419  tRNA-Gln  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0333429  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0058  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0038  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.218666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0088  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000264747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1773  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0046  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000115177  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0107  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0032  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0004  tRNA-Gln  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.40819e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0044  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126068 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4559  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0021  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0132  tRNA-Gln  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056335  normal  0.277016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0041  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000496114  hitchhiker  0.0000000000277547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0028  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0017  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188037  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00012  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000124601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0064  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.7933e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3564  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000198835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0048  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.181876  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0003  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0074  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0038  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000497098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0085  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0095  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000269172  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5017  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0038  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0048  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000232523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>