250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3564 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3564  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3565  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0071  tRNA-Gln  93.24 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.429355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0072  tRNA-Gln  93.24 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.212883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1452  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0129  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000954421  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0127  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0027737  normal  0.534366 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2162  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.133537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0092  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.603959  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2251  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0002  tRNA-Gln  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0003  tRNA-Gln  97.37 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.402253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0132  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056335  normal  0.277016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0030  tRNA-Gln  97.37 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0004  tRNA-Gln  97.37 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.39756 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0005  tRNA-Gln  97.37 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.400107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0061  tRNA-Gln  97.37 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0270894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0126  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000102885  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0123  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000509299  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0151  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916325  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0454  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000558328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0147  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000746626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0149  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000775027  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0119  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00174205  normal  0.184991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0157  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000220492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0121  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.18894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0154  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1775  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000331102  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1773  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1766  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000182708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1769  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA16  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0016  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0027  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000292778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0330  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000145086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4257  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.43895e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0036  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4258  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.53905e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0031  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0030  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771762  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0007  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.102252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0008  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0038  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0011  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0101  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000260011  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0103  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000561751  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0104  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000537672  normal  0.102798 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0094  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300776  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0097  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000737452  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0098  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000673061  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0605  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3145t  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1099  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000225043  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0012  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12185  normal  0.483393 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3152t  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000938948  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0033  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3143t  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000544986  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3147t  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000099101  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1723  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01235  tRNA-Gln  89.36 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna137  tRNA-Gln  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000774984  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna141  tRNA-Gln  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna139  tRNA-Gln  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0041  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000496114  hitchhiker  0.0000000000277547 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna150  tRNA-Gln  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna145  tRNA-Gln  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000913211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>