295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_R0029 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0119  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00174205  normal  0.184991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0157  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000220492  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0103  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0147  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000746626  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0149  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000775027  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0121  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.18894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0123  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000509299  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0126  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000102885  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0065  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000612595  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0154  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0028  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.242939  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0102  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0026  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.151797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0151  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0067  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0094  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300776  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0098  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000673061  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0097  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000737452  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0132  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056335  normal  0.277016 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  92 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  92 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0099  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00011  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000114888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00012  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000124601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0063  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.51209e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0064  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.7933e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0761  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000167269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0794  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000236079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0782  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000722917  normal  0.446267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0722  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000907062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0795  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000207498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0117  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121705  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0127  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4258  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.53905e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0126  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0690  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0059  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5016  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0109  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000980988  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0033  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706309  hitchhiker  0.000775918 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0017  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000337477  normal  0.142924 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0030  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0076  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0063  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0160878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0110  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000374074  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0033  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000363695  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4651  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.16576e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0330  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000145086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5017  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0129  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000954421  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0127  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0027737  normal  0.534366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0721  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153053  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0736  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000556049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0578  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.87866e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0760  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000001352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0464  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.99671e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0032  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666816  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0077  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0031  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750254  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0783  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000582426  normal  0.4419 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0118  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0830  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000784737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0735  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000520956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0101  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000260011  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0103  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000561751  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0104  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000537672  normal  0.102798 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4652  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.35384e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4257  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.43895e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0689  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t012  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000011091  hitchhiker  0.000000000474372 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  92.42 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2234  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0092  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.603959  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t011  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894711  hitchhiker  0.000000000511472 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1773  tRNA-Gln  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0007  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.102252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0008  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00009  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000116069  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0791  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0431042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0005  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5014  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0687  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000017545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>