210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1452 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1452  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2162  tRNA-Gln  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.133537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2251  tRNA-Gln  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0454  tRNA-Gln  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000558328  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0027  tRNA-Gln  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000292778  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0048  tRNA-Gln  94.67 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.181876  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1099  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000225043  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1723  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0605  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  91.94 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3564  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3565  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0049  tRNA-Gln  90.32 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859256  hitchhiker  0.000000216539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  92.45 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  87.3 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0071  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.429355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0072  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.212883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0815  tRNA-Gln  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000000161826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1766  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000182708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1769  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1773  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1775  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000331102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0030  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0061  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0270894  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00008  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000112561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00009  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000116069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0066  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.69731e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0719  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000164709  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0757  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000702107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0718  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136719  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0732  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000561331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4649  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000820589  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4648  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000366514  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0079  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0066  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0358271  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0826  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000524699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0791  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0431042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0581  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000459899  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0758  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000782067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0080  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0827  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000850909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0030  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000433047  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5014  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0687  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000017545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0792  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00549034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0094  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300776  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0097  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000737452  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0098  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000673061  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0733  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000545743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0686  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000180239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0780  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000640046  normal  0.628389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0779  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000652384  normal  0.543785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0030  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771762  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000150139  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000169355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0007  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.102252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4257  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.43895e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0330  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000145086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t1806  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000098323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2564  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0093  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0638  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1386  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4258  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.53905e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0031  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750254  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0003  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.402253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0005  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.400107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0004  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.39756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0008  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  86.79 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>