144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0048 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_R0048  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.181876  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0027  tRNA-Gln  98.67 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000292778  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  94.67 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1452  tRNA-Gln  94.67 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1723  tRNA-Gln  94.67 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1099  tRNA-Gln  94.67 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000225043  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0605  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2162  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.133537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2251  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0454  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000558328  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  95.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  92.31 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0003  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.402253 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000150139  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000169355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0815  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000000161826  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t1806  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000098323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2564  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0093  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0638  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1386  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0004  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.39756 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0005  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.400107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0419  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0333429  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0016  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0053  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000068806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0049  tRNA-Gln  90.24 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859256  hitchhiker  0.000000216539 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3564  tRNA-Gln  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3565  tRNA-Gln  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0030  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1766  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000182708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1769  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1773  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1775  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000331102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0061  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0270894  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5652  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000646012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000184976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000198835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.75916e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0296  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000266549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000964949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000160535  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0094  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300776  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0097  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000737452  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0098  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000673061  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0102  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0074  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0038  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000497098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0085  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0095  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000269172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0193  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000238459  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0147  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000746626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0149  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000775027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0151  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0154  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0157  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000220492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0038  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0048  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000232523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0089  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0099  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0119  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00174205  normal  0.184991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0121  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.18894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0123  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000509299  normal  0.193684 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>