207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0605 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0605  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1723  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1099  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000225043  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0027  tRNA-Gln  95.83 
 
 		 75 bp  119  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000292778  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2251  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0048  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.181876  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2162  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.133537  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1452  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0454  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000558328  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0031  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0030  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771762  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0330  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000145086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4257  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.43895e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4258  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.53905e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0049  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859256  hitchhiker  0.000000216539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0030  tRNA-Gln  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0061  tRNA-Gln  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0270894  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3564  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3565  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0126  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000102885  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0119  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00174205  normal  0.184991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0123  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000509299  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0151  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0157  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000220492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0154  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0121  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.18894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0147  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000746626  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0094  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300776  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0097  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000737452  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0098  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000673061  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0149  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000775027  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0102  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0103  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0020  tRNA-Gln  91.3 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t18  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t54  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0869713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t18  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA19  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.488771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R46  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856686  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R75  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0067  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963096  normal  0.0255259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0033  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61760  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.486139  hitchhiker  0.00483017 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0815  tRNA-Gln  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000000161826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0070  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0007  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.102252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0008  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0050  tRNA-Gln  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.124886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60300  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.18805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0044  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.275376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60290  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0014  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474255  normal  0.24378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0015  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365427  normal  0.400071 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1766  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000182708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1769  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1773  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1775  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000331102  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0029  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0055  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5319  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0063  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.51209e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0064  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.7933e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0114  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.1228e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4652  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.35384e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0077  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0079  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0076  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0028  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000428392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0029  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397179  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5017  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5016  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5014  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0080  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4260  tRNA-Gln  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.09084e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>