30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_R0044 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_R0044  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126068 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0025  tRNA-Gln  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0008  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.825941  normal  0.0317691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t41  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.821705  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0047  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0018  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0048  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.807187  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0025  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0028  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0011  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0068  tRNA-Gln  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0493446  normal  0.903824 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0004  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.40819e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0168  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0036  tRNA-Gln  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427859  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13670  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11068  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0076  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000227874  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0791712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0043  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.394082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0035  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.446482  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0010  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277758  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>