112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_t13670 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_t13670  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11068  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0011  tRNA-Pro  94.67 
 
 		 78 bp  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0076  tRNA-Pro  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000227874  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tPro01  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tPro02  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0058  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0022  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.283237  normal  0.256821 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0021  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0030  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0031  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0001  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0002  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0010  tRNA-Pro  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152064  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0005  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240002  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03900  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.319325  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t47  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.704703  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0065  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.226717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0057  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0039  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0018  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0041  tRNA-Pro  84 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.83752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0009  tRNA-Pro  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0791712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0058  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0026  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0014  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0856304  normal  0.963089 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0040  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0009  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0050  tRNA-Pro  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0001  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.170167  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0050  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309277  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.203232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0012  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.488167  normal  0.183255 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0008  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000700916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0009  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0189312  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0044  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0066  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.89097e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0071  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0705665  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  82.67 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.228938  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  82.67 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0018  tRNA-Pro  84 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0058  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.11838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0061  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0415114  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0054  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0035  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1685  tRNA-Pro  82.67 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.443459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0039  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.780721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0052  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1763  tRNA-Pro  82.67 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0039  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0050  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.134805  hitchhiker  0.00793111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.99617  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0057  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0013  tRNA-Pro  82.67 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000103511  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1378  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14018  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2042  tRNA-Pro  82.67 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000171349  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2135  tRNA-Pro  82.67 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00369966  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2210  tRNA-Pro  82.67 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.225115  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0051  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0007  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_637  tRNA-Pro  82.67 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0811434  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00910953  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0038  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000418206  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0045  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000857544  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24400  tRNA-Pro  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608929  normal  0.879879 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1470  tRNA-Pro  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07940  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00762126  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09860  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.513474  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0263257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0010  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0007  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000798043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0018  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.662018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0066  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.880566  normal  0.0590794 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0007  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0066  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.979842 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1575  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0030  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419312  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0030  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0088  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0062  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0031  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0033  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0057  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000568305  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14026  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0047  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000053333  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0102  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831784  decreased coverage  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0015  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>