298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_R0009 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_R0009  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0063  tRNA-Pro  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305975  normal  0.0658798 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0003  tRNA-Pro  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.308325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0066  tRNA-Pro  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.645419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0001  tRNA-Pro  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207392  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0037  tRNA-Pro  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201404  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0067  tRNA-Pro  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.750062  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0049  tRNA-Pro  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.241293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0064  tRNA-Pro  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713183  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0041  tRNA-Pro  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0012  tRNA-Pro  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142147 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0188  tRNA-Pro  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.320411  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t02  tRNA-Pro  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143246  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  93.15 
 
 
77 bp  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0001  tRNA-Pro  93.15 
 
 
77 bp  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.170167  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0050  tRNA-Pro  96.67 
 
 
74 bp  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0051  tRNA-Pro  96.67 
 
 
74 bp  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0012  tRNA-Pro  92.86 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.488167  normal  0.183255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0011  tRNA-Pro  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162478  normal  0.385967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0026  tRNA-Pro  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0011  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0034  tRNA-Pro  95 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0029  tRNA-Pro  95 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0030  tRNA-Pro  95 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.640007  normal  0.447016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0051  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293622  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0040  tRNA-Pro  93.33 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0010  tRNA-Pro  94.64 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152064  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309277  tRNA-Pro  93.33 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.203232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0025  tRNA-Pro  94.64 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04840  tRNA-Pro  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.51586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  90 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0050  tRNA-Pro  93.1 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0094  tRNA-Pro  90 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0012  tRNA-Pro  90 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0050  tRNA-Pro  92.98 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0050    88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0005  tRNA-Pro  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240002  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0032  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0024  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0017  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0056  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03900  tRNA-Pro  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.319325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0058  tRNA-Pro  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0060  tRNA-Pro  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4158  tRNA-Pro  92.73 
 
 
79 bp  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0013  tRNA-Pro  91.38 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324358  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0029  tRNA-Pro  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0057  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.434776 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4570  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  normal  0.109465 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000462002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5695  tRNA-Pro  92.45 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000661366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5725  tRNA-Pro  92.45 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000708731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0219  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000281593  normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  92.45 
 
 
80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000160288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0007424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000658436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000771561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  92.45 
 
 
80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000117481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  92.45 
 
 
80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000195724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0102  tRNA-Pro  92.45 
 
 
79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5027  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000593186  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0023  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587068  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2126  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5640  tRNA-Pro  92.45 
 
 
79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108099  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0065  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.226717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0050  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0840957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  92.45 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  92.45 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000342912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0025  tRNA-Pro  92.45 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0258602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0786  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39935e-31 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0018  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.662018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0004  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000393504  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0066  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.880566  normal  0.0590794 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4996  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0066  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0039  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247128  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0101  tRNA-Pro  92.45 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0132  tRNA-Pro  92.45 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000929612  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0711  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0015  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0025  tRNA-Pro  92.45 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0259954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5733  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0861  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0136  tRNA-Pro  92.45 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00336688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0105  tRNA-Pro  92.45 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000482088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>