298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24400  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608929  normal  0.879879 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0013  tRNA-Pro  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.793081  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0040  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0023  tRNA-Pro  95.24 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250925  normal  0.248537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0036  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0033  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0030  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419312  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0034  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0742287  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26300  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0030  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14026  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0031  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0035  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09070  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0246462 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0042  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1378  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0007  tRNA-Pro  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0047  tRNA-Pro  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11950  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.883276 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0008  tRNA-Pro  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00816895  normal  0.604163 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0048  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.281731  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0049  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0026  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0018  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0019  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0026  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0035  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0037  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217744 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1418  tRNA-Pro  87.14 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1454  tRNA-Pro  87.14 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00328023  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt024  tRNA-Pro  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000181735  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0092  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2135  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00369966  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04840  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.51586 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0008  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309374  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0038  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000418206  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_R0063  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0026  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0016  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504484  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0025  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0064  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09510  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.500506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0045  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000857544  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309094  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.220954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0057  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309128  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAProVIMSS1309194  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309294  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0012  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309169  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0741  tRNA-Pro  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12440  tRNA-Pro  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0031  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0027  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0058  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0041  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000127927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0017  tRNA-Pro  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0051  tRNA-Pro  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0017  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2210  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.225115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0004  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0094  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0027  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00837628  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0006  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000451843  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2126  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0047  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0063  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0062  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0013  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.959732  normal  0.117453 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0263  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.534581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2226  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000065452  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09860  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.513474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0011  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01261  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00489  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05971  hypothetical protein  96.67 
 
 		 207 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0437067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6030  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285404  normal  0.189385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24870  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00487  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0005  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240002  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0062  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000001951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0062  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768136  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3099t  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000107843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3101t  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000115103  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3155t  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>