297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_R0057 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0040  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000256829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0016  tRNA-Pro  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128175  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0045  tRNA-Pro  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14026  tRNA-Pro  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0035  tRNA-Pro  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0033  tRNA-Pro  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0056  tRNA-Pro  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0030  tRNA-Pro  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419312  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0034  tRNA-Pro  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0742287  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0030  tRNA-Pro  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0063  tRNA-Pro  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0031  tRNA-Pro  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0035  tRNA-Pro  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0026  tRNA-Pro  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0026  tRNA-Pro  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0011  tRNA-Pro  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.253488 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0032  tRNA-Pro  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025005  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1378  tRNA-Pro  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  94.83 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0021  tRNA-Pro  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0691598 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0015  tRNA-Pro  96.23 
 
 
74 bp  89.7  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.523292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0051  tRNA-Pro  90.67 
 
 
78 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0033  tRNA-Pro  90.67 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.614973  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0040  tRNA-Pro  90.67 
 
 
78 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000750731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0036  tRNA-Pro  90.67 
 
 
78 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000605853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0044  tRNA-Pro  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.180839  normal 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09510  tRNA-Pro  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.500506  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0013  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.793081  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0055  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0012  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.762181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0050  tRNA-Pro  96 
 
 
78 bp  83.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166899  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0001  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0033  tRNA-Pro  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0281324  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0011  tRNA-Pro  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0048  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.281731  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15480  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.837894  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0012  tRNA-Pro  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.488167  normal  0.183255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0046  tRNA-Pro  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0117293  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0102  tRNA-Pro  91.8 
 
 
79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000462002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5695  tRNA-Pro  91.8 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000661366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5725  tRNA-Pro  91.8 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000708731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4570  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  normal  0.109465 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.8 
 
 
80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000160288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0007424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000658436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000771561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  91.8 
 
 
80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000117481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.8 
 
 
80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000195724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0861  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5812  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000461866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  91.8 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  91.8 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000342912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0132  tRNA-Pro  91.8 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000929612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0136  tRNA-Pro  91.8 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00336688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0105  tRNA-Pro  91.8 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000482088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0025  tRNA-Pro  91.8 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0259954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0025  tRNA-Pro  91.8 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0258602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5027  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000593186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0038  tRNA-Pro  91.8 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0219  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000281593  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5640  tRNA-Pro  91.8 
 
 
79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5733  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247128  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0101  tRNA-Pro  91.8 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4996  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0786  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39935e-31 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0051  tRNA-Pro  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0051  tRNA-Pro  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  89.33 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0035  tRNA-Pro  89.33 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000101815  hitchhiker  0.00514496 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0037  tRNA-Pro  95.74 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230593  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0014  tRNA-Pro  89.33 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0043  tRNA-Pro  89.33 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0225474  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09860  tRNA-Pro  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.513474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0054  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000175558  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11950  tRNA-Pro  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.883276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0047  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344434  hitchhiker  0.0000000497357 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0028  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0791712  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0011  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03900  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.319325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>