27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_R0031 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_R0031  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0027  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0017  tRNA-Pro  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0017  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0004  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24400  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608929  normal  0.879879 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0048  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.281731  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0034  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0742287  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0031  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14026  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0051  tRNA-Pro  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0013  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.793081  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0058  tRNA-Pro  85.53 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0033  tRNA-Pro  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0030  tRNA-Pro  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0030  tRNA-Pro  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419312  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0051  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0040  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000256829  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0073  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00652705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0079  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0041  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0001  tRNA-Pro  82.89 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000141419  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0050  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0002  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0004  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>