28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE_tRNA-Pro-2 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000141419  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3155t  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3101t  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000115103  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3099t  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000107843  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1813  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2559  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2561  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna131  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000799453  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00487  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00489  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01261  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna020  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000590074  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna018  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000119113  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0031  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0027  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0010  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000189735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0016  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0022  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000445739  unclonable  9.38504e-19 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  89.74 
 
 		 1485 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0552  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.775788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0040  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0475845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0046  tRNA-Trp  100 
 
 		 181 bp  44.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0036  tRNA-Trp  100 
 
 		 175 bp  44.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0025  tRNA-Trp  100 
 
 		 175 bp  44.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000000493252  hitchhiker  0.00000464585 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000388656  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.824149  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0007  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>