97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0010 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0010  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000189735  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0015  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.523292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0016  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0036  tRNA-Pro  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000203357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0021  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0022  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000445739  unclonable  9.38504e-19 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0040  tRNA-Pro  88.33 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0475845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0029  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0037  tRNA-Pro  91.84 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230593  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0011  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.253488 
 
 
-
 
NC_006369  lplt25  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt25  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  93.18 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0066  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000715268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0030  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0033  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.614973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0057  tRNA-Pro  91.49 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0060  tRNA-Pro  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000216222  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0054  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000175558  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0053  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00100217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0047  tRNA-Pro  94.74 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344434  hitchhiker  0.0000000497357 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0046  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0117293  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0044  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.180839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0026  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt16  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0012  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.762181  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0785  tRNA-Pro  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.571174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0047  tRNA-Pro  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00017346  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0026  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0001  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0680  tRNA-Pro  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0731401  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0023  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.247258  normal  0.475897 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0057  tRNA-Pro  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0057  tRNA-Pro  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna46  tRNA-Pro  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0019  tRNA-Pro  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0928705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0007  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4313  tRNA-Pro  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0004  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.781596  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4311  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0002  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000554808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0002  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0006  tRNA-Pro  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.715735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0002  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00090  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0007  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.845776 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0020  tRNA-Pro  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0219771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0002  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00110  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0031  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0041  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0002  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0002  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0010  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.475805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0044  tRNA-Pro  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261582 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0002  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0114532  normal  0.0453152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6001  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0238611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0017  tRNA-Pro  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.334126  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0002  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000141419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0019  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000077385  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0046  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0037  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.47899e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0038  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t40  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000171726  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09140  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0616263 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0014  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12440  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0056  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452415  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0022  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.52358e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0007  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0063  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0495998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0016  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0051  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.659123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0032  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025005  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0045  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0011  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0071  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000011229  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  RSPH17029_0a  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.158501  normal  0.0385896 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.831109  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1546  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0040  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000256829  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0629  tRNA-Asn  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0022  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0089  tRNA-Pro  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.62711e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0020  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130246  normal  0.018662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>