9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0025 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0025  tRNA-Trp  100 
 
 		 175 bp  347  6e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000000493252  hitchhiker  0.00000464585 
 
 
-
 
NC_013158  HUTA_t5  tRNA-Trp  89.41 
 
 		 177 bp  178  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.529826  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0036  tRNA-Trp  89.41 
 
 		 175 bp  178  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0046  tRNA-Trp  90.99 
 
 		 181 bp  127  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0012  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  54  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.146642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0035  tRNA-Trp  100 
 
 		 94 bp  52  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.824149  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>