266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_tRNAProVIMSS1309094 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0026  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309094  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.220954  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309128  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAProVIMSS1309194  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309294  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309169  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309374  tRNA-Pro  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0026  tRNA-Pro  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174672  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0027  tRNA-OTHER  98 
 
 
71 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0040  tRNA-Pro  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309096  tRNA-Pro  100 
 
 
69 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.185  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05971  hypothetical protein  100 
 
 
207 bp  85.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0437067  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0048  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.281731  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0036  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2326  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.261307  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09140  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0616263 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12440  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0047  tRNA-Pro  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344434  hitchhiker  0.0000000497357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0027  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00837628  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0019  tRNA-Pro  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.512808  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1378  tRNA-Pro  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0039  tRNA-Pro  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0013  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0064  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0057  tRNA-Pro  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0040  tRNA-Pro  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000256829  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  87.14 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0021  tRNA-Pro  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0691598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0012  tRNA-Pro  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0035  tRNA-Pro  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04840  tRNA-Pro  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.51586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0002  tRNA-Pro  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0014  tRNA-Pro  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0001  tRNA-Pro  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0013  tRNA-Pro  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.793081  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0040  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0014  tRNA-Pro  86.67 
 
 
78 bp  61.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0016  tRNA-Pro  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128175  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0032  tRNA-Pro  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025005  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0045  tRNA-Pro  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03900  tRNA-Pro  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.319325  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0038  tRNA-Pro  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0037  tRNA-Pro  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0011  tRNA-Pro  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0056  tRNA-Pro  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452415  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0050  tRNA-Pro  88.89 
 
 
73 bp  60  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24400  tRNA-Pro  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608929  normal  0.879879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0020  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951008  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0060  tRNA-Pro  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0058  tRNA-Pro  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0041  tRNA-Pro  91.11 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000127927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0035  tRNA-Pro  87.5 
 
 
78 bp  56  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0026  tRNA-Pro  87.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.094878  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90.7 
 
 
75 bp  54  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.2205  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0023  tRNA-Pro  85.71 
 
 
74 bp  54  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250925  normal  0.248537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0033  tRNA-Pro  85.33 
 
 
75 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.614973  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0053  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000194568  unclonable  8.89969e-24 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0049  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS03760  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0018  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0053  tRNA-Pro  92.11 
 
 
77 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379391  normal  0.108356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0057  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.125773  normal  0.0397591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0017  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26300  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0034  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.199678  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0046  tRNA-Pro  92.11 
 
 
77 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.372739  normal  0.328278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14026  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0025  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0036  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0063  tRNA-Pro  96.67 
 
 
77 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171942  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0002  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.815773  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09860  tRNA-Pro  85.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.513474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0033  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0058  tRNA-Pro  96.67 
 
 
78 bp  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0047  tRNA-Pro  96.67 
 
 
77 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0062  tRNA-Pro  96.67 
 
 
77 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000001951  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0059  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.867475 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0047  tRNA-Pro  96.67 
 
 
77 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0045  tRNA-Pro  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000857544  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0062  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0094  tRNA-Pro  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0030  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419312  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0034  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0742287  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309295  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0030  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0062  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0063  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0031  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0038  tRNA-Pro  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000418206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>