97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_R0023 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250925  normal  0.248537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0040  tRNA-Pro  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0013  tRNA-Pro  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.793081  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09070  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0246462 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0042  tRNA-Pro  95.31 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24400  tRNA-Pro  95.24 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608929  normal  0.879879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0030  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0030  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419312  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0031  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14026  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0033  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0035  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0034  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0742287  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0004  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0026  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11950  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.883276 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1378  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0035  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0019  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0092  tRNA-Pro  88.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12440  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0014  tRNA-Pro  85.94 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309094  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.220954  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0062  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0026  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0021  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0691598 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0006  tRNA-Pro  88.14 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000451843  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0059  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.867475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0057  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.125773  normal  0.0397591 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309374  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0033  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000399427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0008  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0026  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0048  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.281731  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309128  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAProVIMSS1309194  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0036  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309294  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.855611  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309169  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0034  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.155615  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0030  tRNA-Pro  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.777963 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0020  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130246  normal  0.018662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0044  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.180839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0046  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0117293  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0057  tRNA-Pro  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0039  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26300  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0064  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0007  tRNA-Pro  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0035  tRNA-Pro  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0637572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09510  tRNA-Pro  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.500506  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0051  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0010  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04840  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.51586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0051  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0997799  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0012  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0061  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0008  tRNA-Pro  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00816895  normal  0.604163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0054  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0011  tRNA-Pro  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0057  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0052  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0050  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.134805  hitchhiker  0.00793111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0057  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0047  tRNA-Pro  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14040  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0988532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0005  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240002  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0007  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0059  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.193941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0071  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0705665  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0036  tRNA-Pro  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03900  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.319325  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2326  tRNA-Pro  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.261307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0022  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0065  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000795587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0049  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.197597  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0037  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0017  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0051  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0036  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0059  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493454  normal  0.0177961 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0049  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0051  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0051  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0004  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>