114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_R0030 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.777963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11950  tRNA-Pro  91.94 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.883276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0019  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0035  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0065  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000795587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0038  tRNA-Pro  88.71 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS03760  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0044  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0036  tRNA-Pro  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0022  tRNA-Pro  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0040  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000256829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0059  tRNA-Pro  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493454  normal  0.0177961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0057  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.125773  normal  0.0397591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0004  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0059  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.867475 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0062  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0017  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0037  tRNA-Pro  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0035  tRNA-Pro  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0034  tRNA-Pro  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.155615  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt024  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000181735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0067  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0051  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.659123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0022  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.367488  normal  0.0190369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0019  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000286409  normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0017  tRNA-Pro  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0021  tRNA-Pro  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0011  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0027  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0036  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0041  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0037  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217744 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0073  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00652705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0079  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0044  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.408268  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0013  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.793081  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0741  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0051  tRNA-Pro  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6032  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00194019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0040  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0044  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.180839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0038  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000141075  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0046  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0117293  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tPro01  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tPro02  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0035  tRNA-Pro  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0637572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309374  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0023  tRNA-Pro  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250925  normal  0.248537 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0026  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0025  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2791  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000913036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2794  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000175616  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2477  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00937631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2480  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0019483  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0056  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0065  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0034  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0742287  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0046  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0062  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0031  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0711  tRNA-Pro  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0020  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14026  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0050  tRNA-Pro  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0840957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0051  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0051  tRNA-Pro  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_R0063  tRNA-Pro  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09140  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0616263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0011  tRNA-Pro  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.253488 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0008  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0017  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0061005  normal  0.238616 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0018  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.452658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0033  tRNA-Pro  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0012  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0030  tRNA-Pro  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419312  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0030  tRNA-Pro  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0008  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152664  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0012  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0290089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0030  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0001  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0035  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000571794  hitchhiker  0.0000531069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0056  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0001  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3787  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4650  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4652  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0301186  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t08  tRNA-Pro  82.86 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.657243  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0008  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309094  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.220954  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309128  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309169  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0010  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0028  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0102349  hitchhiker  0.000264147 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1470  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.203252  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0053  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379391  normal  0.108356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4569  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0425443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>