281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09140 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09140  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0616263 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12440  tRNA-Pro  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0019  tRNA-Pro  98.36 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.512808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0039  tRNA-Pro  98.36 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0013  tRNA-Pro  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1378  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0026  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0011  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0040  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0047  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344434  hitchhiker  0.0000000497357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0038  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309374  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0036  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0026  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2326  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.261307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0008  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0016  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0056  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452415  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0045  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309169  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309094  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.220954  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309128  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAProVIMSS1309194  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309294  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0046  tRNA-Pro  94.34 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.372739  normal  0.328278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0043  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390511  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0030  tRNA-Pro  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0040  tRNA-Pro  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0018  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0027  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00837628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0020  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130246  normal  0.018662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0011  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.253488 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna46  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0006  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.715735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0005  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0019  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0928705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0089  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0014  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0018  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.767214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0001  tRNA-Pro  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1731  hypothetical protein  97.37 
 
 		 534 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.263329  normal  0.0279515 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0017  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.334126  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0057  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0057  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0040  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181284  normal  0.105985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0035  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0026  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0573  tRNA-Pro  88.52 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0073  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00652705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0079  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0002  tRNA-Pro  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.226409  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0019  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0064  tRNA-Pro  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0297  tRNA-Pro  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000682634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0563  tRNA-Pro  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0041  tRNA-Pro  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000127927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R20  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000933808  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0044  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261582 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0055  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt25  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt25  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0045  tRNA-Pro  88.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000857544  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0785  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.571174  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4313  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0009  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0055  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.758534  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0038  tRNA-Pro  88.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000418206  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0015  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000369215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0066  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000715268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0071  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000628165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0015  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000278716  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1575  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1610  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.815519 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0031  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.942258  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0180  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0680  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0731401  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0020  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0219771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0050  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0040  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000256829  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0058  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0062  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0012  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00369197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0048  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.281731  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0060  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0042  tRNA-Pro  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.010895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0020  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>