270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R20 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_R20  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  97.01 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000933808  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0055  tRNA-Pro  97.01 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.758534  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0015  tRNA-Pro  97.01 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000369215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0015  tRNA-Pro  97.01 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000278716  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0031  tRNA-Pro  97.01 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.942258  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0180  tRNA-Pro  97.01 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0055  tRNA-Pro  97.01 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  95.52 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.226409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0024  tRNA-Pro  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.158579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0097  tRNA-Pro  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000321345  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0051  tRNA-Pro  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000340535  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0573  tRNA-Pro  94.03 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0297  tRNA-Pro  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000682634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0563  tRNA-Pro  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0071  tRNA-Pro  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0063  tRNA-Pro  92.54 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000462002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5695  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000661366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5725  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000708731  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0061  tRNA-Pro  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000960142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 80 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000160288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0007424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000658436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000771561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 80 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000117481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 80 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000195724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0861  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4570  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  normal  0.109465 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000342912  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0057  tRNA-Pro  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000568305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0042  tRNA-Pro  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0105  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000482088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871515  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0033  tRNA-Pro  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0102  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0071  tRNA-Pro  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000628165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0025  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0259954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5640  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5812  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000461866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5733  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5027  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000593186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0132  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000929612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0101  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1575  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1610  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.815519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0136  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00336688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0786  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39935e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4996  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0219  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000281593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0025  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt024  tRNA-Pro  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000181735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0044  tRNA-Pro  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0037  tRNA-Pro  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0044  tRNA-Pro  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0021  tRNA-Pro  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0046  tRNA-Pro  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.372739  normal  0.328278 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0012  tRNA-Pro  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0058  tRNA-Pro  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0029  tRNA-Pro  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1222  tRNA-Pro  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.335805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0038  tRNA-Pro  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000418206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3787  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3790  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4650  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4652  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0301186  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09140  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0616263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0741  tRNA-Pro  86.57 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0090  tRNA-Pro  86.57 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0045  tRNA-Pro  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000857544  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0081  tRNA-Pro  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0073  tRNA-Pro  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00652705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0096  tRNA-Pro  86.57 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0079  tRNA-Pro  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0041  tRNA-Pro  88.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000127927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0013  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0047  tRNA-Pro  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0047  tRNA-Pro  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0014  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0856304  normal  0.963089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0063  tRNA-Pro  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0062  tRNA-Pro  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000001951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>