58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_R0039 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_R0039  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6030  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285404  normal  0.189385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0013  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.959732  normal  0.117453 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0017  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14020  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4331  tRNA-Pro  95.45 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.521695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0028  tRNA-Pro  95.45 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0021  tRNA-Pro  95.45 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.162595 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0023  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0047  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000840593  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0018  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.767214  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09070  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0246462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0032  tRNA-Pro  95.12 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00803703  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0013  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.793081  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0067  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.588797  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0057  tRNA-Pro  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0005  tRNA-Pro  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0040  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0042  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0164  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0008  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0035  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0023  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250925  normal  0.248537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0014  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.267148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0052  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0007  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.471036  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0010  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152064  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0027  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.719402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0033  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0281324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2609  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181156  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36270  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.973598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0026  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0051  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0997799  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15480  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.837894  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0032  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.601376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0075  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0073  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0032  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0034  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0742287  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0006  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0021  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0033  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.281731  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0044  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0018  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0030  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419312  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0024  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0049  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0541281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0018  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0030  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0031  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0037  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14026  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0010  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0033  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0049  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.925267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>