42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0047 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000840593  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0039  tRNA-Pro  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2609  tRNA-Pro  92.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181156  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 
101 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 
93 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.5604 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  100 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  100 
 
 
109 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0038  tRNA-Gly  100 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000426137 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 
96 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.341062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  100 
 
 
109 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  100 
 
 
108 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 
101 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 
118 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.196712 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  100 
 
 
93 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 
112 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14020  tRNA-Pro  84.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0011  tRNA-Pro  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 
100 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0009  tRNA-His  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00853236 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0014  tRNA-Phe  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0656754 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0009  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257244  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0024  tRNA-Phe  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0037  tRNA-Val  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0032  tRNA-Tyr  100 
 
 
117 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0460095  normal  0.912485 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 
130 bp  44.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 
130 bp  44.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 
97 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>