92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0020 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0042  tRNA-Arg  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0024  tRNA-Arg  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0045  tRNA-Arg  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.732814 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0032  tRNA-Arg  89.33 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.341062 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0020  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 91 bp  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0005  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00128122  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0040  tRNA-Arg  88.41 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0021  tRNA-Arg  97.14 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0030  tRNA-Arg  97.14 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.760789 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0008  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000049005  hitchhiker  0.000183919 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 101 bp  54  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0031  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.285038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  85.48 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  85.48 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0038  tRNA-Gly  100 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000426137 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0009  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257244  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 		 118 bp  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.196712 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0032  tRNA-Tyr  100 
 
 		 117 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0460095  normal  0.912485 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  100 
 
 		 109 bp  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 106 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0625472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.5604 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0014  tRNA-Phe  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0656754 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0003  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0024  tRNA-Phe  100 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_8  tRNA-Arg  90 
 
 		 94 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  90 
 
 		 94 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 		 100 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000840593  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 		 97 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0032  tRNA-Gly  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.998395  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.981984 
 
 
-
 
NC_010525  TNEU_0  tRNA-OTHER  100 
 
 		 117 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0067  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0045  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0002  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.259161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0018  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.29875 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0009  tRNA-His  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853236 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 		 96 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 99 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 97 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 97 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0027  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0091  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg01  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 80 bp  44.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000810736  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0013  tRNA-His  85.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 96 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0006  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.884692  hitchhiker  0.000380768 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0038  tRNA-Pro  100 
 
 		 100 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000044076  normal  0.0293745 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0037  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 115 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  83.87 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0016  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00032499  normal  0.0128172 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00420774  hitchhiker  0.0000150687 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0020  tRNA-OTHER  100 
 
 		 126 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.148409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 		 101 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>