42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0009 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0009  tRNA-His  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853236 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0013  tRNA-His  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0022  tRNA-His  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.618008  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  85.48 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 		 100 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0009  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257244  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  100 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 		 97 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0669061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 		 96 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.5604 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 		 118 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.196712 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0038  tRNA-Gly  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000426137 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.341062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000840593  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0014  tRNA-Phe  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0656754 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 101 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0024  tRNA-Phe  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_9  tRNA-Cys  100 
 
 		 111 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0042  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0032  tRNA-Tyr  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0460095  normal  0.912485 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>