61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_R0042 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_R0042  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  188  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0019  tRNA-OTHER  97.89 
 
 		 95 bp  172  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.661812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0043  tRNA-Met  90.24 
 
 		 94 bp  91.7  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.571582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  97.92 
 
 		 101 bp  87.7  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0003  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  85.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 106 bp  85.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0625472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0039  tRNA-OTHER  86.05 
 
 		 95 bp  75.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_2  tRNA-OTHER  92.45 
 
 		 113 bp  73.8  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0003  tRNA-OTHER  90 
 
 		 112 bp  71.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  94.87 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_9  tRNA-Cys  100 
 
 		 111 bp  54  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0015  tRNA-OTHER  100 
 
 		 81 bp  54  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.321152 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 94 bp  54  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0033  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  54  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0014  tRNA-OTHER  100 
 
 		 80 bp  54  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0006  tRNA-Gly  100 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138313  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0013  tRNA-His  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  TNEU_0  tRNA-OTHER  100 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.285038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0014  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0656754 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0024  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.5604 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0015  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123591 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0029  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 		 96 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0031  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0020  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000277692 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0025  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 108 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 		 101 bp  46.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0552891  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0025  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0043  tRNA-Thr  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0030  tRNA-Met  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0032  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.998395  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0049  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.151378 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0023  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.135769  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0040  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.738588 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0014  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0029  tRNA-Glu  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0026  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 118 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.196712 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0039  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.147165  hitchhiker  0.000226333 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0040  tRNA-Glu  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00032499  normal  0.0128172 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0009  tRNA-His  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853236 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0011  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  100 
 
 		 109 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0026  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 97 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0037  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 97 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0005  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>