35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0013 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0013  tRNA-His  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0009  tRNA-His  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  89.36 
 
 		 96 bp  54  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_9  tRNA-Cys  100 
 
 		 111 bp  54  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0015  tRNA-Phe  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000431362 
 
 
-
 
NC_010525  TNEU_0  tRNA-OTHER  100 
 
 		 117 bp  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0042  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  89.13 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0003  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 106 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0625472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.285038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0669061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 108 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0717588  decreased coverage  0.00491532 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0019  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.661812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.571582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.5604 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0014  tRNA-Phe  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0656754 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0023  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 116 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0046836 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 		 101 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0027  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 99 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  85.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>