40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0035 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 93 bp  75.8  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  87.69 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_5  tRNA-Asn  93.62 
 
 		 111 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0013  tRNA-His  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  91.11 
 
 		 96 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_4  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 94 bp  54  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0532674 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  96.67 
 
 		 99 bp  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  86.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 97 bp  50.1  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 108 bp  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 109 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0006  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.884692  hitchhiker  0.000380768 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0005  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 104 bp  50.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 98 bp  50.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0027  tRNA-Arg  85.07 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00420774  hitchhiker  0.0000150687 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 96 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0017  tRNA-Pro  100 
 
 		 108 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00176898 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt07  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 96 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  TNEU_0  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 117 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 119 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0032  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.341062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  85.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0015  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000431362 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0011  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.106894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>