69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0019 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  98.11 
 
 		 96 bp  97.6  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  97.56 
 
 		 108 bp  73.8  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  97.44 
 
 		 109 bp  69.9  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  90.32 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0032  tRNA-Trp  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0012  tRNA-Trp  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.146642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 		 101 bp  58  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0016  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00032499  normal  0.0128172 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0040  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0013  tRNA-His  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.5604 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_9  tRNA-Cys  100 
 
 		 111 bp  52  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0035  tRNA-Trp  90.48 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  100 
 
 		 80 bp  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0038  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.266869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 80 bp  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0018  tRNA-OTHER  100 
 
 		 98 bp  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.352421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0012  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 112 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0015  tRNA-Phe  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000431362 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0032  tRNA-His  100 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.622503  normal  0.311828 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0017  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0002  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 113 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0043  tRNA-OTHER  100 
 
 		 68 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0034  tRNA-Met  100 
 
 		 99 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t15  tRNA-Asp  100 
 
 		 128 bp  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.150704  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0006  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 101 bp  50.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.35465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 98 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0005  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 104 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0027  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00420774  hitchhiker  0.0000150687 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0717588  decreased coverage  0.00491532 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0019  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.661812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0043  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0006  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.884692  hitchhiker  0.000380768 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_11  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 112 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000281475 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0039  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0474661 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t40  tRNA-Glu  100 
 
 		 130 bp  44.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.290488  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0028  tRNA-His  100 
 
 		 103 bp  44.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0007  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0027  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 109 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0023  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.135769  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0037  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0044  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 109 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.335529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0023  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 109 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0777816  normal  0.377314 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0039  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.345264 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0044  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>