36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0015 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0015  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000431362 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0033  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0014  tRNA-Phe  91.8 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0656754 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0026  tRNA-Phe  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000149355 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0007  tRNA-Phe  97.06 
 
 		 88 bp  60  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000518418  hitchhiker  0.000190112 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0013  tRNA-His  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  85.33 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0021  tRNA-His  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695669 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0026  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 118 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.196712 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 80 bp  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 80 bp  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.186619  normal  0.0165444 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0034  tRNA-Met  96.55 
 
 		 99 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.658502  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0017  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.5604 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0011  tRNA-Phe  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 108 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0035  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 101 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 109 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 96 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.51045  hitchhiker  0.0091927 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_9  tRNA-Cys  96.3 
 
 		 111 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_1  tRNA-OTHER  100 
 
 		 70 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt07  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>