12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0007 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0007  tRNA-Phe  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000518418  hitchhiker  0.000190112 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0033  tRNA-Phe  100 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0038  tRNA-Tyr  97.06 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0015  tRNA-Phe  97.06 
 
 		 77 bp  60  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000431362 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0030  tRNA-Met  96.88 
 
 		 92 bp  56  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0040  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.12813 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0026  tRNA-Phe  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000149355 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0022  tRNA-Met  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0005  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0024  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0014  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0656754 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0040  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.738588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>