12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0030 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0030  tRNA-Met  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0022  tRNA-Met  85.87 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0043  tRNA-Thr  100 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0017  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 88 bp  56  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0552891  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0033  tRNA-Phe  96.88 
 
 		 74 bp  56  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0007  tRNA-Phe  96.88 
 
 		 88 bp  56  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000518418  hitchhiker  0.000190112 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0023  tRNA-OTHER  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0046836 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0042  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0019  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.661812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0036  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216959 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0038  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0089  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.946417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>