9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0022 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0022  tRNA-Met  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0030  tRNA-Met  85.87 
 
 		 92 bp  77.8  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0023  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0033  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0043  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0007  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000518418  hitchhiker  0.000190112 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0038  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>