60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0008 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  94.87 
 
 		 77 bp  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  89.87 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0032  tRNA-Trp  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  94.83 
 
 		 93 bp  83.8  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_4  tRNA-Lys  91.53 
 
 		 94 bp  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0532674 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  90.16 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  93.62 
 
 		 101 bp  69.9  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  93.62 
 
 		 101 bp  69.9  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0013  tRNA-OTHER  97.3 
 
 		 101 bp  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  85.53 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0001  tRNA-OTHER  97.14 
 
 		 98 bp  61.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0811775 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_5  tRNA-Asn  93.02 
 
 		 111 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  94.74 
 
 		 99 bp  60  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 94 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0028  tRNA-OTHER  97.06 
 
 		 95 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000246213 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0024  tRNA-OTHER  97.06 
 
 		 98 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0359457 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0012  tRNA-Trp  87.88 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.146642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  94.59 
 
 		 98 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0024  tRNA-OTHER  94.59 
 
 		 101 bp  58  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  94.59 
 
 		 119 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  86.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  91.89 
 
 		 98 bp  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0047  tRNA-Lys  86.15 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271132  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0022  tRNA-Met  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0006  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  100 
 
 		 3080 bp  44.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11950  tRNA-Met  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0612113  normal  0.0857463 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0043  tRNA-OTHER  100 
 
 		 102 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.049603  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 97 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0150168  hitchhiker  0.0000162071 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  82.05 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 		 110 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.245868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 		 104 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.595381 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 123 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0049  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00365867  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0031  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.334076  hitchhiker  0.00102641 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_8  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 98 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0049  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000106187  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0023  tRNA-Thr  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 98 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 100 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30036  predicted protein  100 
 
 		 171 bp  44.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210806  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 103 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>