23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0023 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0023  tRNA-Thr  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0043  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0017  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0552891  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0001  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.526231  decreased coverage  0.00115585 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0022  tRNA-Met  96.88 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0021  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19680  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0053  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1369  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.802652  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0022  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.618008  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0052  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000162603  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0569  sRNA  100 
 
 		 375 bp  44.1  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0494255  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04010  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000945479  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04380  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04300  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0239342  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00420  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00120  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00563215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>