11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0026 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0026  tRNA-Phe  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000149355 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0015  tRNA-Phe  88.41 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000431362 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0011  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0014  tRNA-Phe  88.14 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0656754 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0028  tRNA-Phe  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0010  tRNA-Phe  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0037  tRNA-Phe  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264586  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0033  tRNA-Phe  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0006  tRNA-Phe  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000148153 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 109 bp  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0007  tRNA-Phe  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000518418  hitchhiker  0.000190112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>