31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CMAQ_2 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  CMAQ_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_1  tRNA-OTHER  98.57 
 
 		 70 bp  131  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0048  tRNA-Ser  92.19 
 
 		 95 bp  87.7  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0015  tRNA-Ala  95.65 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.794494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.51045  hitchhiker  0.0091927 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0022  tRNA-Ala  93.18 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.805604 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0042  tRNA-OTHER  94.74 
 
 		 96 bp  60  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0036  tRNA-Ala  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 94 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0005  tRNA-OTHER  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.686297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  100 
 
 		 94 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0011  tRNA-Ala  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.759432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0022  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112576 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0025  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65986  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0045  tRNA-Val  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0004  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0464601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0669061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0015  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000431362 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0018  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.114799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0022  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00441825  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0017  tRNA-Pro  100 
 
 		 108 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00176898 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.186619  normal  0.0165444 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0017  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0717588  decreased coverage  0.00491532 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.658502  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0042  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>