27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0012 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0019  tRNA-Arg  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.186619  normal  0.0165444 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0027  tRNA-Arg  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.658502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0049  tRNA-Arg  95.59 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.880915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0023  tRNA-Arg  95.59 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.915707  normal  0.016906 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0008  tRNA-Arg  94.2 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0027  tRNA-OTHER  92.75 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000206606  hitchhiker  0.0000802829 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0021  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.905442  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0012  tRNA-Arg  87.14 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.683536  normal  0.458428 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0043  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 68 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0018  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 98 bp  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.352421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0015  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000431362 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t15  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 128 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.150704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0025  tRNA-Arg  85 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 80 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 80 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0034  tRNA-Met  96.43 
 
 		 99 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.51045  hitchhiker  0.0091927 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0032  tRNA-His  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.622503  normal  0.311828 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_1  tRNA-OTHER  100 
 
 		 70 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0889822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>