174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_R0021 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_R0021  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695669 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0030  tRNA-His  93.51 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.142316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24880  tRNA-His  95.59 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28660  tRNA-His  96.61 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0457487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0024  tRNA-His  94.92 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0047  tRNA-His  94.92 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.627276  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0015  tRNA-His  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0023  tRNA-His  89.61 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00261193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0036  tRNA-His  93.44 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0021  tRNA-His  90 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19680  tRNA-His  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0038  tRNA-His  91.53 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0016  tRNA-His  91.53 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1396  tRNA-His  87.01 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0042  tRNA-His  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0037  tRNA-His  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0609753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0028  tRNA-His  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0033  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0057  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000568305  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0061  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000960142  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08830  tRNA-His  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406412  normal  0.0611739 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0861  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4570  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  normal  0.109465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0786  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39935e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000462002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5695  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000661366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5725  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000708731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  90 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000160288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0007424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000658436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000771561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  90 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000117481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  90 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000195724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000342912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0219  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000281593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0006  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0021  tRNA-His  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.730448  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0036  tRNA-His  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0128871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5640  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108099  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0063  tRNA-His  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5733  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0046  tRNA-His  94.74 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216845  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0033  tRNA-His  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.704433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0002  tRNA-His  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0033  tRNA-His  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5027  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000593186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5812  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000461866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0102  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0025  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0101  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0132  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000929612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0044  tRNA-His  94.74 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000143676 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4996  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0025  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0259954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0105  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000482088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0136  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00336688  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14029  tRNA-His  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205987 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0010  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0082  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0022  tRNA-His  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0041  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0248017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1222  tRNA-Pro  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.335805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0032  tRNA-His  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0069  tRNA-His  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0023  tRNA-His  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0014  tRNA-His  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0044  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0037  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0012  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0015  tRNA-Phe  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000431362 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0044  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0053  tRNA-His  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0015  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.523292  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3788  tRNA-His  84.42 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4649  tRNA-His  84.42 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tHis01  tRNA-His  84.42 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000397081  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna021  tRNA-His  84.42 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna019  tRNA-His  84.42 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000572511  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0037  tRNA-His  84.42 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.28441  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0027  tRNA-His  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000556999  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0005  tRNA-His  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0063  tRNA-Pro  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1575  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1610  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.815519 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>