44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0031 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0042  tRNA-Arg  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0032  tRNA-Arg  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.341062 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0024  tRNA-Arg  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0045  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.732814 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0006  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.884692  hitchhiker  0.000380768 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0022  tRNA-Arg  97.14 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 94 bp  56  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_8  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 94 bp  56  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0040  tRNA-Arg  89.58 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0020  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 91 bp  54  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0030  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.760789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0013  tRNA-His  87.1 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0033  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 96 bp  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0017  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 101 bp  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 101 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt07  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  96.43 
 
 		 94 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  96.43 
 
 		 94 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0049  tRNA-Asp  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0010  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.51045  hitchhiker  0.0091927 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_2  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_1  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 70 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0038  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000426137 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0015  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000431362 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0017  tRNA-Pro  100 
 
 		 108 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00176898 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  83.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0051  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613833  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>