25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4331 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4331  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.521695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0021  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.162595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0032  tRNA-Pro  98.72 
 
 		 78 bp  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00803703  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0032  tRNA-Pro  86.3 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0580782  normal  0.580774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6030  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285404  normal  0.189385 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0017  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0013  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.959732  normal  0.117453 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0039  tRNA-Pro  95.45 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0008  tRNA-Pro  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0041  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0019  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000286409  normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0044  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.408268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0040  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181284  normal  0.105985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0022  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.367488  normal  0.0190369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0046  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243465 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0022  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0067  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0008  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0033  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.614973  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0015  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0035  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0049  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0067  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0049  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.858771  hitchhiker  0.000592487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>