51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0022 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0022  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0018  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0225129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0047  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0005  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0028  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0023  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0020  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0148448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0027  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0027  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.997139  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0051  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6003  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0038  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0029  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0022  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0157761 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0010  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4331  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.521695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0021  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.162595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0018  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000105771  hitchhiker  0.00192537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t101  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna090  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00922026  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0006  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228394  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0001  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0051  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t064  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0492871  hitchhiker  0.000000924528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0062  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0145  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0524672  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0029  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0133  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850923  normal  0.0129533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0025  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000750128  normal  0.0484618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0022  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03611  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0131  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000204709  normal  0.0765104 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0024  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2070  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0014  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.796812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0028  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.851168  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0054  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0088  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000142546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0025  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0113  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429315  hitchhiker  0.00021617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0013  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0580782  normal  0.580774 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0026  tRNA-Thr  83.78 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446733  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0015  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0049  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.858771  hitchhiker  0.000592487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0035  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>