63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0004 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0028  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0018  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0225129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0005  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0038  tRNA-Thr  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0024  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0012  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0044  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0010  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0043  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1673  tRNA-Thr  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000301806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2191  tRNA-Thr  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000534865  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2233  tRNA-Thr  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000102912  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0048  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.446269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0022  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0019  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0027  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.997139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0020  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0148448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0027  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0047  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0012  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000512028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0023  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0015  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000030839  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0062  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0046  tRNA-Thr  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0011  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000691484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07727  tRNA-Thr  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0017  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00199817  normal  0.0150591 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0016  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0054  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0039  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296877  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.802652  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0439  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000182942  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt07  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1719  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778292  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1466  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000857792  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0026  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446733  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0051  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1326  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0006  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228394  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0001  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0028  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0009  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0008  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA47  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 68 bp  44.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.327653 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0053  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0023  tRNA-Thr  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0001  tRNA-Thr  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.526231  decreased coverage  0.00115585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0035  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0436953  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0022  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0157761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0009  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0035  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0049  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0022  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.618008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>