30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0005 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0005  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0018  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0225129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0028  tRNA-Thr  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0022  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0022  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0157761 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0027  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0027  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.997139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0020  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0148448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0023  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0029  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0038  tRNA-Thr  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0048  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.446269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0062  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0028  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0051  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0050  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0019  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0001  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0024  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353494  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2233  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000102912  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2191  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000534865  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1673  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000301806  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228394  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0013  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>