218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0034 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0011  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000691484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07727  tRNA-Thr  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0074  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747725  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0043  tRNA-Thr  91.38 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0016  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0050  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2233  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000102912  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1673  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000301806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2191  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000534865  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt07  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna051  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000648525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0017  tRNA-Thr  88.71 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00199817  normal  0.0150591 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00234  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0016  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0029  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.217954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0039  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296877  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0012  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000512028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0014  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000293663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0054  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0031  tRNA-Thr  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0008  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000961846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0012  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000603563  normal  0.0893983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0013  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480722  hitchhiker  0.0000885703 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2722  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000264941  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0009  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0028  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t064  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0492871  hitchhiker  0.000000924528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0145  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0524672  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t101  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0070  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0133  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850923  normal  0.0129533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000750128  normal  0.0484618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0123  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000054481  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna090  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00922026  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0131  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000204709  normal  0.0765104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.851168  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000105771  hitchhiker  0.00192537 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1719  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778292  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0013  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0113  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429315  hitchhiker  0.00021617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.796812  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2070  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0023  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0024  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03611  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0022  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1466  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000857792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000141414  hitchhiker  0.00853262 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0061  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00680264  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0028  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0037  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  0.113649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0032  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.387211 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0050  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165947  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1326  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00274987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0015  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000030839  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0032  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144022  normal  0.819537 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0028  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0004  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0004  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0008  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0054  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0389191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0020  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0003  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000292995  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0023  tRNA-Thr  100 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000013952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0035  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000289059  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0070  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0439  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000182942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0013  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0022  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000255037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0002  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.385644 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309354  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309355  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.824908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0041  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0014  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0054  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0055  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0045  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309081  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309082  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.248116  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAThrVIMSS1309113  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309202  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.083443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0059  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R22  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0247278  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0047  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAThrVIMSS1309157  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0025  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0088  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000142546  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0055  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138155  hitchhiker  0.00896758 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0047  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000841137  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0016  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236341  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0015  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.123572  normal  0.0601938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0058  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0055  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.872606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>