16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0022 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0022  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0157761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0005  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0022  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0018  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0225129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0029  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0028  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0028  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0041  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0006  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0007  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0009  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1222  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0686417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>