51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0029 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0029  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0029  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553385  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0050  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0041  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0011  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0049  tRNA-Thr  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0032  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0025  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0062  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0015  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101097  hitchhiker  0.004712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0032  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0008  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0245883  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0021  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.178891  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0005  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0022  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0024  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131276  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0008  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0978186  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0022  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0157761 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0025  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000025626  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0057  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000331146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0023  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.177577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0038  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0064  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0059  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000197967  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0024  tRNA-Met  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288853 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0011  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0041  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0049  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0010  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0012  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000162811  hitchhiker  0.00834179 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07721  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0013  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt022  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000116471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0053  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000194568  unclonable  8.89969e-24 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0011  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000312741  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0018  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0225129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0014  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757854  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0056  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243934  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0009  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0003  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.304948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0010  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624159  hitchhiker  0.00328072 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t08  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0023  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0015  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000775633  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>