37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0028 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0018  tRNA-Thr  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0225129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0005  tRNA-Thr  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0038  tRNA-Thr  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0022  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0019  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0048  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.446269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0024  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0012  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0044  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353494  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0023  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0020  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0148448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0062  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0027  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0027  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.997139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0011  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000691484  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0043  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0006  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228394  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0001  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0028  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0051  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1673  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000301806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0012  tRNA-Thr  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000512028  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2233  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000102912  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2191  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000534865  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0022  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0157761 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0014  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0015  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000030839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.951156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.490827 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0027  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>