49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_R0035 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0033  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0003  tRNA-Met  90.41 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0024  tRNA-Met  90.41 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0032  tRNA-Met  90.41 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.094935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0001  tRNA-Met  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.699138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0066  tRNA-Met  97.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0008  tRNA-Met  95.24 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0448209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0024  tRNA-Met  95.24 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0001  tRNA-Met  95.24 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213191 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_364  tRNA-Met  95.24 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0082247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Met-1  tRNA-Met  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000665936  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0001  tRNA-Met  95.35 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.103849  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0005  tRNA-Met  95.35 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.245348 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  95.35 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0036  tRNA-Met  93.02 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.572801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06700  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0043  tRNA-Met  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0041  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0236723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0018  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0038  tRNA-Met  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0167531  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0039  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0019  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0022  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13990  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314954  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0050  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.325417  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0037  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0033  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.311584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06650  tRNA-Met  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0162553  normal  0.0748507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0013  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0076  tRNA-Met  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0032  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366508  normal  0.496339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0019  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.513289  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0021  tRNA-Met  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114234  normal  0.0173767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000793329  hitchhiker  0.000000622773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0006  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276121  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0039  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04831  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0026  tRNA-Asn  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000338371  normal  0.10818 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0045  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000363633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0029  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0127801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0039  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092174  hitchhiker  0.00180785 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000152851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>