195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0026 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_R0026  tRNA-Asn  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000338371  normal  0.10818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0045  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000031214  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0003  tRNA-Asn  95.08 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.173284  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAsnVIMSS1309105  tRNA-Asn  95.08 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.512806  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAsnVIMSS1309137  tRNA-Asn  95.08 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.898434  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAsnVIMSS1309178  tRNA-Asn  95.08 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0005  tRNA-Asn  93.44 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.404272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0052  tRNA-Asn  93.44 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  93.44 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAsnVIMSS1309287  tRNA-Asn  93.44 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0030  tRNA-Asn  91.8 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693953  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAsnVIMSS1309217  tRNA-Asn  91.8 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAsnVIMSS1309370  tRNA-Asn  91.8 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0025  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.691429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0024  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0043  tRNA-Asn  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0039  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092174  hitchhiker  0.00180785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0029  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0127801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0036  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1454  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0044  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0403004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0064  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187513  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt06  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00593265  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0589  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.513289  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0037  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2889  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000182855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2890  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000200194  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2891  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000194238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2892  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000182855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0057  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000731299  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0087  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000568391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0025  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148774  normal  0.456967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0024  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.143684  normal  0.454789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0084  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5671  tRNA-Asx  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0035  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.043106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0028  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0033  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.104706  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0002  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409498 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0600  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000379275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5706  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000905345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0037  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0034  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.171102  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0043  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5148  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  normal  0.479478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4777  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213851  hitchhiker  0.0000000000000219436 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0524  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4385300000000005e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0077  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000930167  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0038  tRNA-Asn  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0036  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  85.25 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4299  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0027  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000000619703  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0028  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000184427  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0742  tRNA-Asn  85.25 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00204496  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0018  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0028  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.227518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0026  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0032  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0049  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000556498  normal  0.485056 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0046  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6038  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000594197  hitchhiker  0.00000000000000771476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0064  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0124  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0118  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000046805  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0075  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000559002  normal  0.199391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0120  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1370  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0039  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.722493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0040  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.710582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0031  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0069  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000102362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0071  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000229648  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0072  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000849142  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0119  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000444921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>