72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_R0024 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0024  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0003  tRNA-Met  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0032  tRNA-Met  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.094935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0019  tRNA-Met  93.65 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0018  tRNA-Met  93.65 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000793329  hitchhiker  0.000000622773 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0035  tRNA-Met  90.41 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.572801  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0054  tRNA-Met  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000046509  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0020  tRNA-Met  95.24 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0126987  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0066  tRNA-Met  97.22 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0005  tRNA-Met  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.245348 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_364  tRNA-Met  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0082247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0008  tRNA-Met  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0448209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3569  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2777  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379753  normal  0.476878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3363  tRNA-Met  96.77 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3658  tRNA-Met  96.77 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3473  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.103015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3467  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3403  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3399  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143765  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0018  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.689825  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3898  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4382  tRNA-Met  96.77 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.156688  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0013  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.046309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0042  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.873086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0017  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0140072  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0072  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0079  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0501725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0015  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74849  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00056  tRNA-Ile  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.366108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0025  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0080  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0819155  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0043  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0603767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4687  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00526927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4699  tRNA-Met  96.77 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0029  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5058  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5070  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0389718  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Met-1  tRNA-Met  88.89 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000665936  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0038  tRNA-Met  96.97 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0167531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0019  tRNA-Met  96.97 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0033  tRNA-Met  87.72 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0050  tRNA-Met  96.97 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.325417  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13990  tRNA-Met  96.97 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314954  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0001  tRNA-Met  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.103849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  96.97 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  96.97 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0037  tRNA-Met  96.97 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0043  tRNA-Met  96.88 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26570  tRNA-Lys  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000438766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0076  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607006 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00847  tRNA-Met  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0020  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0817304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0020  tRNA-Met  94.29 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235412  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0048  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00910953  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0001  tRNA-Met  94.29 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.699138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0046  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna017  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.274857  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0003  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00215026  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0615  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.294067  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0029  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAMetVIMSS1309196  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.868171  hitchhiker  0.00000970855 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3515  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0046  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0056  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0022  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0042  tRNA-Met  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>